La Comunidad Árbol de Vida cuenta con diversos ministerios o programas internos que ayudan a fortalecer el modo de vida de la comunidad, su identidad como pueblo y la vida de discipulado. Varios de estos programas apoyan a los hijos de miembros de la comunidad en su crecimiento en la fe; otros ayudan en nuestras expresiones de culto comunitario o en la formación de los miembros en la fe.

• Niños para Cristo (NPC): Ese programa está dedicado a apoyar a los padres en la formación de los niños de 3 a 9 años.
• Caminando con Cristo (CCC): Este programa continúa la formación de los niños en sus últimos tres niveles de educación primaria (aproximadamente de 10 a 12 años de edad inclusive).
• Shalom: Este es el programa que genera actividades formativas para los hijos adolescentes de los miembros de la comunidad.
• Ministerio de Música: Este ministerio desempeña un papel importantísimo en nuestras asambleas comunitarias de oración, sirviendo de apoyo y guía para el canto comunitario.
• Confraternidad de Cristo Rey: Es la agrupación de los miembros católicos de Árbol de Vida, que los vincula con la Iglesia arquidiocesana y ofrece actividades litúrgicas y de catequesis.